"Она" - это если использовать тупую кальку. Или если считать, что это настолько употребимое в русском языке слово, что оно уже стало акрофонетической аббревиатурой (то есть читается "фда", а не "эф-дэ-а").

А так ФДА - это Управление по контролю за F и D, так что оно.